Em maio de 2025, a Estônia experimentou um alargamento do seu défice comercial, que se expandiu para EUR 281 milhões, de EUR 203 milhões no mesmo mês do ano anterior. Este aumento deveu-se a um crescimento maior nas importações em comparação com as exportações. Especificamente, as exportações aumentaram 2% ano-a-ano, atingindo EUR 1.573 milhões, com os envios para países da UE subindo 3%, embora tenha havido uma ligeira diminuição para países não pertencentes à UE em 2%. Observou-se um crescimento significativo nas exportações de produtos agrícolas e preparações alimentícias (16%), equipamentos de transporte (15%) e equipamentos elétricos (11%).
Por outro lado, as importações dispararam 6%, totalizando EUR 1.855 milhões, impulsionadas principalmente por um aumento notável de 54% nas compras de países não pertencentes à UE, mesmo que as importações de países da UE tenham caído 1%. O crescimento das importações foi particularmente acentuado em setores como papel e artigos relacionados (11%), diversos artigos manufaturados (8%) e equipamentos elétricos (7%). No geral, nos primeiros cinco meses de 2025, o défice comercial da Estônia somou EUR 1.464 milhões, acima dos EUR 1.302 milhões no mesmo período do ano anterior.